Os ThunderCats procuram um novo lar, pois seu planeta natal, Thundera, explodiu. Porém, mudanças nos planos de viagem ocorrem quando um grupo inimigo vindo do planeta conhecido como Plun-dar, "O Ataque Mutante", deixa sua nave severamente incapacitada. Enquanto isso, um menino chamado Lion deve aprender o que significa tornar-se um homem e aprender a ser o "Senhor dos ThunderCats", então, ele aprende a utilizar o poder da "Espada Justiceira de Omens" e conhecer a fonte de força do seu povo, o "Olho de Thundera".